Protein–RNA interactions for Protein: B2RUR8

Otud7b, OTU domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud7bB2RUR8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otud7bB2RUR8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud7bB2RUR8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms