Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf3B2RUQ2 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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