Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud4B2RRE7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud4B2RRE7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud4B2RRE7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud4B2RRE7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud4B2RRE7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud4B2RRE7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud4B2RRE7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud4B2RRE7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud4B2RRE7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud4B2RRE7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud4B2RRE7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud4B2RRE7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud4B2RRE7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud4B2RRE7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud4B2RRE7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud4B2RRE7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud4B2RRE7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud4B2RRE7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud4B2RRE7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud4B2RRE7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud4B2RRE7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud4B2RRE7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Otud4B2RRE7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Otud4B2RRE7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Otud4B2RRE7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud4B2RRE7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms