Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf518bB2RRE4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms