Protein–RNA interactions for Protein: B2RQY6

BC035947, BC035947 protein, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035947B2RQY6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BC035947B2RQY6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BC035947B2RQY6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms