Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms