Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Ssxb8B1AY40 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssxb8B1AY40 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ssxb8B1AY40 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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Ssxb8B1AY40 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssxb8B1AY40 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssxb8B1AY40 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Ssxb8B1AY40 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssxb8B1AY40 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssxb8B1AY40 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Ssxb8B1AY40 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Ssxb8B1AY40 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssxb8B1AY40 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssxb8B1AY40 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssxb8B1AY40 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssxb8B1AY40 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssxb8B1AY40 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssxb8B1AY40 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssxb8B1AY40 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssxb8B1AY40 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssxb8B1AY40 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssxb8B1AY40 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssxb8B1AY40 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssxb8B1AY40 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssxb8B1AY40 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssxb8B1AY40 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssxb8B1AY40 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssxb8B1AY40 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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