Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap3aB1AWZ3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms