Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Grik3B1AS29 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms