Protein–RNA interactions for Protein: A6X935

Itih4, Inter alpha-trypsin inhibitor, heavy chain 4, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itih4A6X935 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itih4A6X935 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms