Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
4930435E12RikA6X8Z9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms