Protein–RNA interactions for Protein: A2J008

Trgv2, MCG146472 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trgv2A2J008 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trgv2A2J008 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trgv2A2J008 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trgv2A2J008 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trgv2A2J008 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trgv2A2J008 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trgv2A2J008 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trgv2A2J008 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trgv2A2J008 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trgv2A2J008 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trgv2A2J008 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trgv2A2J008 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trgv2A2J008 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trgv2A2J008 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trgv2A2J008 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trgv2A2J008 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trgv2A2J008 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trgv2A2J008 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trgv2A2J008 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trgv2A2J008 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trgv2A2J008 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trgv2A2J008 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trgv2A2J008 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trgv2A2J008 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trgv2A2J008 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trgv2A2J008 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trgv2A2J008 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trgv2A2J008 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trgv2A2J008 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trgv2A2J008 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trgv2A2J008 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trgv2A2J008 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trgv2A2J008 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms