Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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