Protein–RNA interactions for Protein: A2AMT6

Vmn1r2, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r2A2AMT6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r2A2AMT6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r2A2AMT6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms