Protein–RNA interactions for Protein: A2AM80

Fam43b, Family with sequence similarity 43, member B, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam43bA2AM80 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fam43bA2AM80 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Fam43bA2AM80 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam43bA2AM80 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam43bA2AM80 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam43bA2AM80 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam43bA2AM80 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam43bA2AM80 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam43bA2AM80 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam43bA2AM80 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam43bA2AM80 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam43bA2AM80 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam43bA2AM80 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam43bA2AM80 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam43bA2AM80 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam43bA2AM80 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam43bA2AM80 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam43bA2AM80 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam43bA2AM80 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam43bA2AM80 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam43bA2AM80 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam43bA2AM80 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam43bA2AM80 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam43bA2AM80 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam43bA2AM80 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam43bA2AM80 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam43bA2AM80 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam43bA2AM80 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam43bA2AM80 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam43bA2AM80 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam43bA2AM80 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam43bA2AM80 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam43bA2AM80 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam43bA2AM80 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam43bA2AM80 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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