Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc163A2AGD7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms