Protein–RNA interactions for Protein: A2AGA4

Rhbdl2, Rhomboid-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl2A2AGA4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhbdl2A2AGA4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms