Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC12□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC12□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms