Protein–RNA interactions for Protein: A2A6H3

Fbxo47, F-box only protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo47A2A6H3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbxo47A2A6H3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbxo47A2A6H3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbxo47A2A6H3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbxo47A2A6H3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fbxo47A2A6H3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fbxo47A2A6H3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fbxo47A2A6H3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fbxo47A2A6H3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fbxo47A2A6H3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fbxo47A2A6H3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fbxo47A2A6H3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fbxo47A2A6H3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fbxo47A2A6H3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fbxo47A2A6H3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fbxo47A2A6H3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fbxo47A2A6H3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fbxo47A2A6H3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fbxo47A2A6H3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fbxo47A2A6H3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo47A2A6H3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms