Protein–RNA interactions for Protein: A2A432

Cul4b, Cullin-4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4bA2A432 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cul4bA2A432 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cul4bA2A432 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cul4bA2A432 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cul4bA2A432 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cul4bA2A432 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cul4bA2A432 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cul4bA2A432 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cul4bA2A432 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cul4bA2A432 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cul4bA2A432 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cul4bA2A432 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cul4bA2A432 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cul4bA2A432 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cul4bA2A432 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cul4bA2A432 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cul4bA2A432 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cul4bA2A432 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cul4bA2A432 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cul4bA2A432 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cul4bA2A432 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cul4bA2A432 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cul4bA2A432 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cul4bA2A432 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cul4bA2A432 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cul4bA2A432 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cul4bA2A432 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cul4bA2A432 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cul4bA2A432 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cul4bA2A432 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cul4bA2A432 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cul4bA2A432 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cul4bA2A432 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cul4bA2A432 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cul4bA2A432 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cul4bA2A432 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cul4bA2A432 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cul4bA2A432 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cul4bA2A432 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cul4bA2A432 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cul4bA2A432 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cul4bA2A432 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cul4bA2A432 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cul4bA2A432 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cul4bA2A432 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cul4bA2A432 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cul4bA2A432 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cul4bA2A432 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cul4bA2A432 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cul4bA2A432 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cul4bA2A432 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cul4bA2A432 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cul4bA2A432 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cul4bA2A432 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cul4bA2A432 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cul4bA2A432 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms