Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms