Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc173A0JLY1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc173A0JLY1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms