Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YDB2

4930469K13Rik, RIKEN cDNA 4930469K13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930469K13RikA0A286YDB2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930469K13RikA0A286YDB2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930469K13RikA0A286YDB2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930469K13RikA0A286YDB2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
4930469K13RikA0A286YDB2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930469K13RikA0A286YDB2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930469K13RikA0A286YDB2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930469K13RikA0A286YDB2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930469K13RikA0A286YDB2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930469K13RikA0A286YDB2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930469K13RikA0A286YDB2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930469K13RikA0A286YDB2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930469K13RikA0A286YDB2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930469K13RikA0A286YDB2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930469K13RikA0A286YDB2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930469K13RikA0A286YDB2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930469K13RikA0A286YDB2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930469K13RikA0A286YDB2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930469K13RikA0A286YDB2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930469K13RikA0A286YDB2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
4930469K13RikA0A286YDB2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930469K13RikA0A286YDB2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
4930469K13RikA0A286YDB2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930469K13RikA0A286YDB2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930469K13RikA0A286YDB2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
4930469K13RikA0A286YDB2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930469K13RikA0A286YDB2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930469K13RikA0A286YDB2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930469K13RikA0A286YDB2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930469K13RikA0A286YDB2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930469K13RikA0A286YDB2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930469K13RikA0A286YDB2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930469K13RikA0A286YDB2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930469K13RikA0A286YDB2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930469K13RikA0A286YDB2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930469K13RikA0A286YDB2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930469K13RikA0A286YDB2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930469K13RikA0A286YDB2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930469K13RikA0A286YDB2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930469K13RikA0A286YDB2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930469K13RikA0A286YDB2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930469K13RikA0A286YDB2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930469K13RikA0A286YDB2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930469K13RikA0A286YDB2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930469K13RikA0A286YDB2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
4930469K13RikA0A286YDB2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930469K13RikA0A286YDB2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms