Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQ45

6430628N08Rik, MCG1049118, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms