Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P5

Trbv26, T cell receptor beta, variable 26 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv26A0A0B4J1P5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv26A0A0B4J1P5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms