Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYP6

Sirpb1a, Signal-regulatory protein beta 1A, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
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Sirpb1aA0A0A6YYP6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Sirpb1aA0A0A6YYP6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Sirpb1aA0A0A6YYP6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Sirpb1aA0A0A6YYP6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Sirpb1aA0A0A6YYP6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Sirpb1aA0A0A6YYP6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Sirpb1aA0A0A6YYP6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Sirpb1aA0A0A6YYP6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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