Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YX06

Trbv21, T cell receptor beta, variable 21 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv21A0A0A6YX06 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv21A0A0A6YX06 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv21A0A0A6YX06 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv21A0A0A6YX06 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv21A0A0A6YX06 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv21A0A0A6YX06 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv21A0A0A6YX06 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv21A0A0A6YX06 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv21A0A0A6YX06 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv21A0A0A6YX06 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv21A0A0A6YX06 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv21A0A0A6YX06 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv21A0A0A6YX06 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv21A0A0A6YX06 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv21A0A0A6YX06 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv21A0A0A6YX06 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv21A0A0A6YX06 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trbv21A0A0A6YX06 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv21A0A0A6YX06 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv21A0A0A6YX06 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv21A0A0A6YX06 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv21A0A0A6YX06 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trbv21A0A0A6YX06 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv21A0A0A6YX06 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv21A0A0A6YX06 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv21A0A0A6YX06 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv21A0A0A6YX06 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv21A0A0A6YX06 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trbv21A0A0A6YX06 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trbv21A0A0A6YX06 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trbv21A0A0A6YX06 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trbv21A0A0A6YX06 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trbv21A0A0A6YX06 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trbv21A0A0A6YX06 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv21A0A0A6YX06 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv21A0A0A6YX06 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trbv21A0A0A6YX06 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv21A0A0A6YX06 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv21A0A0A6YX06 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv21A0A0A6YX06 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trbv21A0A0A6YX06 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv21A0A0A6YX06 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv21A0A0A6YX06 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv21A0A0A6YX06 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv21A0A0A6YX06 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv21A0A0A6YX06 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv21A0A0A6YX06 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv21A0A0A6YX06 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv21A0A0A6YX06 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv21A0A0A6YX06 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv21A0A0A6YX06 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv21A0A0A6YX06 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv21A0A0A6YX06 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv21A0A0A6YX06 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv21A0A0A6YX06 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv21A0A0A6YX06 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv21A0A0A6YX06 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv21A0A0A6YX06 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv21A0A0A6YX06 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trbv21A0A0A6YX06 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv21A0A0A6YX06 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv21A0A0A6YX06 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv21A0A0A6YX06 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv21A0A0A6YX06 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv21A0A0A6YX06 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv21A0A0A6YX06 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv21A0A0A6YX06 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv21A0A0A6YX06 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trbv21A0A0A6YX06 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trbv21A0A0A6YX06 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv21A0A0A6YX06 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv21A0A0A6YX06 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv21A0A0A6YX06 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trbv21A0A0A6YX06 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv21A0A0A6YX06 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv21A0A0A6YX06 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv21A0A0A6YX06 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv21A0A0A6YX06 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv21A0A0A6YX06 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv21A0A0A6YX06 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv21A0A0A6YX06 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv21A0A0A6YX06 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv21A0A0A6YX06 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv21A0A0A6YX06 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv21A0A0A6YX06 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv21A0A0A6YX06 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv21A0A0A6YX06 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trbv21A0A0A6YX06 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv21A0A0A6YX06 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv21A0A0A6YX06 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv21A0A0A6YX06 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv21A0A0A6YX06 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv21A0A0A6YX06 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv21A0A0A6YX06 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv21A0A0A6YX06 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trbv21A0A0A6YX06 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trbv21A0A0A6YX06 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv21A0A0A6YX06 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv21A0A0A6YX06 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv21A0A0A6YX06 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms