Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQ89

2210011C24Rik, MCG5930, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2210011C24RikA0A087WQ89 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
2210011C24RikA0A087WQ89 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms