Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ9

TMOD4, Tropomodulin-4, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD4Q9NZQ9 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TMOD4Q9NZQ9 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.6 ms