Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SGCBQ16585 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SGCBQ16585 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SGCBQ16585 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SGCBQ16585 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SGCBQ16585 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SGCBQ16585 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SGCBQ16585 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SGCBQ16585 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SGCBQ16585 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SGCBQ16585 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SGCBQ16585 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SGCBQ16585 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SGCBQ16585 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SGCBQ16585 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SGCBQ16585 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SGCBQ16585 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SGCBQ16585 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SGCBQ16585 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SGCBQ16585 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SGCBQ16585 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SGCBQ16585 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SGCBQ16585 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
SGCBQ16585 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SGCBQ16585 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SGCBQ16585 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SGCBQ16585 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SGCBQ16585 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SGCBQ16585 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SGCBQ16585 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SGCBQ16585 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SGCBQ16585 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SGCBQ16585 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SGCBQ16585 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SGCBQ16585 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SGCBQ16585 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SGCBQ16585 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SGCBQ16585 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SGCBQ16585 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
SGCBQ16585 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SGCBQ16585 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SGCBQ16585 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SGCBQ16585 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SGCBQ16585 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SGCBQ16585 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SGCBQ16585 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SGCBQ16585 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SGCBQ16585 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SGCBQ16585 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SGCBQ16585 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SGCBQ16585 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SGCBQ16585 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SGCBQ16585 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SGCBQ16585 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SGCBQ16585 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SGCBQ16585 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SGCBQ16585 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SGCBQ16585 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SGCBQ16585 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SGCBQ16585 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SGCBQ16585 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SGCBQ16585 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SGCBQ16585 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SGCBQ16585 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SGCBQ16585 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SGCBQ16585 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SGCBQ16585 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SGCBQ16585 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SGCBQ16585 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SGCBQ16585 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SGCBQ16585 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
SGCBQ16585 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SGCBQ16585 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
SGCBQ16585 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SGCBQ16585 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SGCBQ16585 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SGCBQ16585 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SGCBQ16585 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SGCBQ16585 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SGCBQ16585 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SGCBQ16585 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SGCBQ16585 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
SGCBQ16585 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SGCBQ16585 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
SGCBQ16585 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SGCBQ16585 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SGCBQ16585 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SGCBQ16585 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SGCBQ16585 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SGCBQ16585 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SGCBQ16585 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCBQ16585 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCBQ16585 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCBQ16585 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCBQ16585 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCBQ16585 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SGCBQ16585 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCBQ16585 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SGCBQ16585 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCBQ16585 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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