Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PDE1CQ14123 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.5 ms