Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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CDH18Q13634 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDH18Q13634 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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CDH18Q13634 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
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CDH18Q13634 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
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CDH18Q13634 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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CDH18Q13634 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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CDH18Q13634 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
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CDH18Q13634 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
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CDH18Q13634 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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CDH18Q13634 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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