Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
KRR1Q13601 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
KRR1Q13601 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC1.27□□□□□ -2.21
KRR1Q13601 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
KRR1Q13601 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
KRR1Q13601 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
KRR1Q13601 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
KRR1Q13601 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
KRR1Q13601 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
KRR1Q13601 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
KRR1Q13601 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
KRR1Q13601 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
KRR1Q13601 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
KRR1Q13601 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
KRR1Q13601 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
KRR1Q13601 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
KRR1Q13601 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
KRR1Q13601 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
KRR1Q13601 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
KRR1Q13601 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC1.27□□□□□ -2.21
KRR1Q13601 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
KRR1Q13601 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
KRR1Q13601 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
KRR1Q13601 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
KRR1Q13601 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
KRR1Q13601 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
KRR1Q13601 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
KRR1Q13601 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
KRR1Q13601 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
KRR1Q13601 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
KRR1Q13601 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
KRR1Q13601 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
KRR1Q13601 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
KRR1Q13601 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
KRR1Q13601 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
KRR1Q13601 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
KRR1Q13601 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
KRR1Q13601 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
KRR1Q13601 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
KRR1Q13601 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
KRR1Q13601 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
KRR1Q13601 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
KRR1Q13601 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
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