Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
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