Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NPRL3Q12980 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NPRL3Q12980 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NPRL3Q12980 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NPRL3Q12980 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
NPRL3Q12980 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NPRL3Q12980 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
NPRL3Q12980 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
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NPRL3Q12980 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
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NPRL3Q12980 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NPRL3Q12980 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NPRL3Q12980 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NPRL3Q12980 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NPRL3Q12980 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NPRL3Q12980 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NPRL3Q12980 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NPRL3Q12980 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NPRL3Q12980 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
NPRL3Q12980 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
NPRL3Q12980 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
NPRL3Q12980 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NPRL3Q12980 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
NPRL3Q12980 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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NPRL3Q12980 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NPRL3Q12980 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NPRL3Q12980 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
NPRL3Q12980 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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NPRL3Q12980 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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NPRL3Q12980 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NPRL3Q12980 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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NPRL3Q12980 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NPRL3Q12980 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NPRL3Q12980 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NPRL3Q12980 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NPRL3Q12980 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
NPRL3Q12980 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NPRL3Q12980 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
NPRL3Q12980 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NPRL3Q12980 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
NPRL3Q12980 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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NPRL3Q12980 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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NPRL3Q12980 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
NPRL3Q12980 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
NPRL3Q12980 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NPRL3Q12980 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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NPRL3Q12980 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NPRL3Q12980 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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NPRL3Q12980 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
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NPRL3Q12980 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NPRL3Q12980 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
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NPRL3Q12980 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
NPRL3Q12980 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NPRL3Q12980 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NPRL3Q12980 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NPRL3Q12980 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NPRL3Q12980 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NPRL3Q12980 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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NPRL3Q12980 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NPRL3Q12980 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
NPRL3Q12980 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
NPRL3Q12980 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NPRL3Q12980 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
NPRL3Q12980 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
NPRL3Q12980 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NPRL3Q12980 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NPRL3Q12980 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
NPRL3Q12980 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
NPRL3Q12980 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NPRL3Q12980 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
NPRL3Q12980 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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