Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LRRTM2O43300 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
LRRTM2O43300 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LRRTM2O43300 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LRRTM2O43300 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
LRRTM2O43300 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LRRTM2O43300 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LRRTM2O43300 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LRRTM2O43300 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LRRTM2O43300 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LRRTM2O43300 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LRRTM2O43300 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
LRRTM2O43300 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LRRTM2O43300 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LRRTM2O43300 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LRRTM2O43300 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LRRTM2O43300 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LRRTM2O43300 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LRRTM2O43300 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
LRRTM2O43300 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
LRRTM2O43300 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
LRRTM2O43300 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LRRTM2O43300 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LRRTM2O43300 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LRRTM2O43300 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LRRTM2O43300 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
LRRTM2O43300 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
LRRTM2O43300 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LRRTM2O43300 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LRRTM2O43300 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
LRRTM2O43300 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
LRRTM2O43300 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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LRRTM2O43300 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LRRTM2O43300 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LRRTM2O43300 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
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LRRTM2O43300 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
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LRRTM2O43300 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LRRTM2O43300 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
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LRRTM2O43300 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
LRRTM2O43300 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LRRTM2O43300 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
LRRTM2O43300 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LRRTM2O43300 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LRRTM2O43300 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
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LRRTM2O43300 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LRRTM2O43300 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LRRTM2O43300 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LRRTM2O43300 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LRRTM2O43300 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LRRTM2O43300 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LRRTM2O43300 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LRRTM2O43300 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LRRTM2O43300 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LRRTM2O43300 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
LRRTM2O43300 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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