Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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KNOP1Q1ED39 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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KNOP1Q1ED39 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
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KNOP1Q1ED39 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
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