Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CDO1Q16878 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms