Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.2 ms