Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC2.16□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
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