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| FHL3 | Q13643 | MIR1911-201 | ENST00000410783 | 80 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC003092.1-201 | ENST00000415536 | 639 nt | TSL 3 BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| FHL3 | Q13643 | MTCO2P27-201 | ENST00000420740 | 428 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC099548.1-201 | ENST00000421443 | 426 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
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| FHL3 | Q13643 | TUSC7-203 | ENST00000477539 | 2415 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| FHL3 | Q13643 | DMD-229 | ENST00000619831 | 13734 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| FHL3 | Q13643 | ORC4-201 | ENST00000264169 | 6598 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| FHL3 | Q13643 | LINC01847-201 | ENST00000522627 | 5607 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
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| FHL3 | Q13643 | FAN1-202 | ENST00000561594 | 2738 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| FHL3 | Q13643 | TJP1-204 | ENST00000400011 | 6764 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| FHL3 | Q13643 | EIF4E3-202 | ENST00000389826 | 6083 nt | TSL 5 BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| FHL3 | Q13643 | NFIB-210 | ENST00000543693 | 7622 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC233263.6-201 | ENST00000631132 | 1963 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| FHL3 | Q13643 | ZCCHC10-201 | ENST00000324170 | 2178 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
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| FHL3 | Q13643 | AC007256.1-201 | ENST00000392253 | 2765 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
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| FHL3 | Q13643 | AC139713.2-215 | ENST00000641428 | 5037 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| FHL3 | Q13643 | Y_RNA.459-201 | ENST00000384251 | 102 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
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| FHL3 | Q13643 | U3.37-201 | ENST00000408528 | 213 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
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| FHL3 | Q13643 | AC135371.1-201 | ENST00000446964 | 453 nt | TSL 2 BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| FHL3 | Q13643 | PTPRG-AS1-210 | ENST00000498655 | 547 nt | TSL 4 BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC092440.1-201 | ENST00000512563 | 571 nt | TSL 4 BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| FHL3 | Q13643 | SNORA31.1-201 | ENST00000515993 | 133 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
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| FHL3 | Q13643 | RNU1-54P-201 | ENST00000517181 | 120 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| FHL3 | Q13643 | MDM2-221 | ENST00000517852 | 393 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC124290.1-202 | ENST00000523342 | 387 nt | TSL 3 BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| FHL3 | Q13643 | COPS8P3-201 | ENST00000526024 | 482 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC013762.1-201 | ENST00000531136 | 467 nt | TSL 3 BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC010186.2-204 | ENST00000537668 | 439 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| FHL3 | Q13643 | PRH1-206 | ENST00000543626 | 710 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| FHL3 | Q13643 | IMMP1LP2-201 | ENST00000552954 | 492 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC021979.1-201 | ENST00000553822 | 336 nt | TSL 3 BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| FHL3 | Q13643 | MIR4474-201 | ENST00000579189 | 78 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| FHL3 | Q13643 | RN7SL600P-201 | ENST00000581811 | 299 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| FHL3 | Q13643 | MIR5690-201 | ENST00000583739 | 73 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC015911.9-201 | ENST00000591634 | 185 nt | TSL 5 BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC080078.1-201 | ENST00000603643 | 410 nt | TSL 3 BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC245389.1-201 | ENST00000605141 | 529 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC090425.1-201 | ENST00000610007 | 140 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| FHL3 | Q13643 | CDC27-207 | ENST00000531206 | 3177 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| FHL3 | Q13643 | SYT16-205 | ENST00000568344 | 13978 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| FHL3 | Q13643 | BCLAF3-202 | ENST00000379682 | 3217 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| FHL3 | Q13643 | TMEM71-202 | ENST00000377901 | 1861 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| FHL3 | Q13643 | DAZ4-206 | ENST00000449750 | 3271 nt | TSL 5 BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| FHL3 | Q13643 | FAM35DP-201 | ENST00000323387 | 2712 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC069228.1-201 | ENST00000546936 | 1615 nt | TSL 3 BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| FHL3 | Q13643 | MIR369-201 | ENST00000362155 | 70 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| FHL3 | Q13643 | RNA5SP388-201 | ENST00000362584 | 119 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| FHL3 | Q13643 | Y_RNA.202-201 | ENST00000364083 | 110 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| FHL3 | Q13643 | TSACC-205 | ENST00000368255 | 751 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| FHL3 | Q13643 | DEFB110-202 | ENST00000393660 | 189 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| FHL3 | Q13643 | Y_RNA.605-201 | ENST00000410577 | 105 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| FHL3 | Q13643 | RNA5SP31-201 | ENST00000411144 | 127 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |