Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ATRQ13535 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ATRQ13535 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC0.58□□□□□ -2.32
ATRQ13535 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
ATRQ13535 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC0.58□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC0.58□□□□□ -2.32
ATRQ13535 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
ATRQ13535 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC0.58□□□□□ -2.32
ATRQ13535 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ATRQ13535 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.58□□□□□ -2.32
ATRQ13535 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC0.58□□□□□ -2.32
ATRQ13535 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC0.58□□□□□ -2.32
ATRQ13535 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ATRQ13535 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ATRQ13535 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ATRQ13535 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
ATRQ13535 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC0.57□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ATRQ13535 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ATRQ13535 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
ATRQ13535 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
ATRQ13535 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ATRQ13535 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ATRQ13535 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
ATRQ13535 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ATRQ13535 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
ATRQ13535 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
ATRQ13535 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
ATRQ13535 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC0.57□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ATRQ13535 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
ATRQ13535 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ATRQ13535 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ATRQ13535 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.56□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ATRQ13535 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
ATRQ13535 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC0.56□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC0.56□□□□□ -2.32
ATRQ13535 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ATRQ13535 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ATRQ13535 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ATRQ13535 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ATRQ13535 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ATRQ13535 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ATRQ13535 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ATRQ13535 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
ATRQ13535 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ATRQ13535 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ATRQ13535 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ATRQ13535 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
ATRQ13535 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC0.55□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ATRQ13535 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
ATRQ13535 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ATRQ13535 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ATRQ13535 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ATRQ13535 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ATRQ13535 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ATRQ13535 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ATRQ13535 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ATRQ13535 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.2 ms