Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NME3Q13232 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NME3Q13232 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NME3Q13232 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NME3Q13232 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NME3Q13232 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NME3Q13232 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NME3Q13232 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NME3Q13232 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NME3Q13232 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NME3Q13232 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
NME3Q13232 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NME3Q13232 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NME3Q13232 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NME3Q13232 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
NME3Q13232 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NME3Q13232 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NME3Q13232 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NME3Q13232 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NME3Q13232 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NME3Q13232 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NME3Q13232 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NME3Q13232 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NME3Q13232 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NME3Q13232 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
NME3Q13232 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NME3Q13232 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NME3Q13232 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NME3Q13232 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NME3Q13232 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NME3Q13232 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NME3Q13232 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NME3Q13232 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
NME3Q13232 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
NME3Q13232 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NME3Q13232 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
NME3Q13232 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NME3Q13232 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NME3Q13232 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NME3Q13232 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NME3Q13232 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NME3Q13232 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NME3Q13232 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NME3Q13232 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NME3Q13232 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NME3Q13232 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NME3Q13232 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NME3Q13232 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NME3Q13232 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NME3Q13232 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NME3Q13232 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NME3Q13232 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NME3Q13232 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.3 ms