Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
TROQ12816 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TROQ12816 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TROQ12816 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
TROQ12816 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
TROQ12816 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TROQ12816 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TROQ12816 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TROQ12816 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
TROQ12816 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TROQ12816 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TROQ12816 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TROQ12816 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
TROQ12816 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
TROQ12816 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TROQ12816 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TROQ12816 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
TROQ12816 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TROQ12816 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
TROQ12816 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TROQ12816 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
TROQ12816 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TROQ12816 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TROQ12816 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
TROQ12816 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TROQ12816 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TROQ12816 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TROQ12816 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TROQ12816 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
TROQ12816 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TROQ12816 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TROQ12816 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
TROQ12816 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TROQ12816 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TROQ12816 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TROQ12816 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TROQ12816 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TROQ12816 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
TROQ12816 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TROQ12816 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
TROQ12816 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TROQ12816 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TROQ12816 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TROQ12816 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TROQ12816 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TROQ12816 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TROQ12816 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
TROQ12816 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TROQ12816 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
TROQ12816 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TROQ12816 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TROQ12816 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TROQ12816 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TROQ12816 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC1.04□□□□□ -2.24
TROQ12816 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TROQ12816 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TROQ12816 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TROQ12816 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TROQ12816 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
TROQ12816 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TROQ12816 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TROQ12816 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TROQ12816 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
TROQ12816 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
TROQ12816 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TROQ12816 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
TROQ12816 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
TROQ12816 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TROQ12816 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
TROQ12816 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC1.03□□□□□ -2.24
TROQ12816 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TROQ12816 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TROQ12816 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TROQ12816 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TROQ12816 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TROQ12816 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
TROQ12816 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
TROQ12816 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TROQ12816 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TROQ12816 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TROQ12816 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TROQ12816 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TROQ12816 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
TROQ12816 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TROQ12816 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TROQ12816 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TROQ12816 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
TROQ12816 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TROQ12816 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
TROQ12816 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TROQ12816 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TROQ12816 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
TROQ12816 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TROQ12816 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TROQ12816 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TROQ12816 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TROQ12816 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TROQ12816 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TROQ12816 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC1.01□□□□□ -2.25
TROQ12816 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
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