Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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GTF3C1Q12789 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
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GTF3C1Q12789 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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GTF3C1Q12789 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
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GTF3C1Q12789 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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GTF3C1Q12789 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
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GTF3C1Q12789 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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GTF3C1Q12789 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GTF3C1Q12789 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
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