Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRMP28827 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
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PTPRMP28827 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
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PTPRMP28827 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
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PTPRMP28827 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRMP28827 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
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