Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATG3Q9NT62 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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