Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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ZBED3Q96IU2 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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ZBED3Q96IU2 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
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ZBED3Q96IU2 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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ZBED3Q96IU2 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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ZBED3Q96IU2 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
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ZBED3Q96IU2 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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ZBED3Q96IU2 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
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ZBED3Q96IU2 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
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ZBED3Q96IU2 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
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ZBED3Q96IU2 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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ZBED3Q96IU2 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
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ZBED3Q96IU2 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
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