Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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