Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERPUD1Q15011 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERPUD1Q15011 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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